2015年本科毕业于西北农林科技大学理学院、2018年硕士毕业于西北工业大学理学院计算数学系，2023年博士毕业于北京大学生命科学学院细胞生物学系（导师：汤富酬教授）。2023年至2025年获得北京大学“博雅”博士后资助在北京大学前沿交叉学科研究院从事博士后工作，期间入选国家资助博士后研究计划，获中国博士后科学基金面上项目资助及“拜耳”博士后称号。2025年至今就职于北京师范大学生命科学学院。
研究工作立足于单细胞多组学测序与生信分析技术的研究与生殖发育生物学前沿问题的交叉领域，具体涵盖以下三个方面：
1.前沿单细胞测序技术研究：基于二代和三代（单分子）测序平台的单细胞基因组、转录组和表观组测序技术的研究与应用。
2.生殖生物学应用：利用单细胞多组学测序技术及生信分析手段，系统解析人类精子发生过程中的表观遗传调控，揭示男性不育症的发病机理。
3.生物信息学算法：发展高效的生物信息学算法与计算工具，用于整合多组学数据，深度挖掘细胞异质性背后的动态调控规律。
· Xie H*, Li J*, Zhang L*, Xu X*, Tang F. Epigenetic Dynamics of Human Spermatogenesis and Their Dysregulation in Non-Obstructive Azoospermia. (Under review)
· Xie H*, Li W*, Hu Y, Yang C, Lu J, Guo Y, Wen L, Tang F. De novo assembly of human genome at single-cell levels. Nucleic Acids Research. 2022 Jul 22;50(13):7479-7492.
· Xie H*, Li W*, Guo Y, Su X, Chen K, Wen L, Tang F. Long-read-based single sperm genome sequencing for chromosome-wide haplotype phasing of both SNPs and SVs. Nucleic Acids Research. 2023 Aug 25;51(15):8020-8034.
· Liu Z*, Hu Y*, Xie H*, Chen K*, Wen L, Fu W, Zhou X, Tang F. Single-Cell Chromatin Accessibility Analysis Reveals the Epigenetic Basis and Signature Transcription Factors for the Molecular Subtypes of Colorectal Cancers. Cancer Discovery. 2024 Jun 3;14(6):1082-1105.
· Wang Y*, Xie H*, Chang X*, Hu W*, Li M, Li Y, Liu H, Cheng H, Wang S, Zhou L, Shen D, Dou S, Ma R, Mao Y, Zhu H, Zhang X, Zheng Y, Ye X, Wen L, Kee K, Cui H, Tang F. Single-Cell Dissection of the Multiomic Landscape of High-Grade Serous Ovarian Cancer. Cancer Research. 2022 Nov 2;82(21):3903-3916.
· Yang, C, Zhou, M, Xie, H. et al. LncADeep performance on full-length transcripts. Nature Machine Intelligence 3, 197–198 (2021). https://doi.org/10.1038/s42256-019-0108-2.
· Dong J, Zhou P, Wu Y, Chen Y, Xie H, Gao Y, Lu J, Yang J, Zhang X, Wen L, Li T, Tang F. Integrating single-cell datasets with ambiguous batch information by incorporating molecular network features. Brief Bioinform. 2022 Jan 17;23(1):bbab366.
(*为共同第一作者)
