2025年12月-至今，北京师范大学生命科学学院，讲师；
2023年7月-2025年12月，北京大学，生物医学工程，博士后（北京大学“博雅”博士后，导师：汤富酬教授）；
2018年9月-2023年7月，北京大学，细胞生物学，博士（导师：汤富酬教授）；
2015年9月-2018年4月，西北工业大学，计算数学，硕士；
2011年9月-2015年7月，西北农林科技大学，本科；
研究工作长期致力于单细胞多组学前沿测序技术与发育生物学的交叉研究。近年来在国际学术期刊发表高水平论文12篇，其中以第一作者（含共同第一作者）在Nucleic Acids Research (2篇)，Cancer Discovery, Cancer Research 等国际著名期刊发表多篇原创性研究论文。曾入选国家资助博士后研究人员计划，荣获北京大学“拜耳”优秀博士后，并主持中国博士后科学基金面上项目。课题组致力于通过单细胞测序技术与高效算法开发，深度解析细胞命运决定背后的表观遗传奥秘。
课题组坚持“干湿结合”的研究理念，具体涵盖以下三个重点方向：
1.前沿单细胞测序技术研究：基于二代和三代（单分子）测序平台的单细胞基因组、转录组和表观组测序技术的研究与应用。
2.生殖发育表观遗传学解析： 结合前沿多组学技术与模式生物/临床样本，系统描绘精子发生与减数分裂过程中的染色质动态重塑图谱，揭示男性不育症（如非梗阻性无精子症）的分子致病机理。
3.生物信息学算法：发展高效的生物信息学算法与计算工具，用于整合多组学数据，深度挖掘细胞异质性背后的动态调控规律。
· Xie H*, Li J*, Zhang L*, Xu X*, Tang F. Epigenetic Dynamics of Human Spermatogenesis and Their Dysregulation in Non-Obstructive Azoospermia. (Under review)
· Xie H*, Li W*, Hu Y, Yang C, Lu J, Guo Y, Wen L, Tang F. De novo assembly of human genome at single-cell levels. Nucleic Acids Research. 2022 Jul 22;50(13):7479-7492.
· Xie H*, Li W*, Guo Y, Su X, Chen K, Wen L, Tang F. Long-read-based single sperm genome sequencing for chromosome-wide haplotype phasing of both SNPs and SVs. Nucleic Acids Research. 2023 Aug 25;51(15):8020-8034.
· Liu Z*, Hu Y*, Xie H*, Chen K*, Wen L, Fu W, Zhou X, Tang F. Single-Cell Chromatin Accessibility Analysis Reveals the Epigenetic Basis and Signature Transcription Factors for the Molecular Subtypes of Colorectal Cancers. Cancer Discovery. 2024 Jun 3;14(6):1082-1105.
· Wang Y*, Xie H*, Chang X*, Hu W*, Li M, Li Y, Liu H, Cheng H, Wang S, Zhou L, Shen D, Dou S, Ma R, Mao Y, Zhu H, Zhang X, Zheng Y, Ye X, Wen L, Kee K, Cui H, Tang F. Single-Cell Dissection of the Multiomic Landscape of High-Grade Serous Ovarian Cancer. Cancer Research. 2022 Nov 2;82(21):3903-3916.
· Yang, C, Zhou, M, Xie, H. et al. LncADeep performance on full-length transcripts. Nature Machine Intelligence 3, 197–198 (2021). https://doi.org/10.1038/s42256-019-0108-2.
· Dong J, Zhou P, Wu Y, Chen Y, Xie H, Gao Y, Lu J, Yang J, Zhang X, Wen L, Li T, Tang F. Integrating single-cell datasets with ambiguous batch information by incorporating molecular network features. Brief Bioinform. 2022 Jan 17;23(1):bbab366.
(*为共同第一作者)
