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2013年本科毕业于北京大学生命科学学院，2018年于美国圣路易斯华盛顿大学取得分子遗传学与基因组学博士，研究方向为酵母物种表型演化的遗传基础，在博士研究中首次揭示了线粒体基因组对于酿酒酵母属中耐冷耐热表型演化的重要贡献，并通过等位基因差异表达分析等方法探究了顺式调控区域对表型演化的贡献。2019年至2023年获得EIPOD-玛丽·居里博士后基金资助，在位于德国海德堡的欧洲分子生物学实验室（EMBL）发育生物学单元进行博士后研究，主要课题包括果蝇早期胚胎发育网络的实验室演化、基因调控元件的可演化性、靶向诱变的基因组编辑工具开发等。2024年入职北京师范大学生命科学学院生态学系。
长期致力于采用高通量遗传学实验与计算相结合的研究手段为处在争议中的演化生物学理论模型提供经验性证据，探究生物多样性演化的遗传基础，尤其是基因调控对演化的贡献。目前，已在Science Advances，Genome Biology and Evolution，G3，Philosophical Transactions B等国际期刊上发表第一作者论文4篇，并曾获国际分子生物学与演化会议（SMBE）中最佳研究生海报奖。
围绕基因调控在生物演化中的贡献这一核心问题，展开以下几方面的研究：
1. 在酵母模型中，结合突变扫描、基因组编辑技术、实验室演化等多种遗传干扰方法探究基因调控元件与网络的可演化性。
2. 以线粒体基因调控网络为重点，探究酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）与葡萄汁酵母（Saccharomyces uvarum）温度表型分歧的遗传基础。
3. 在果蝇模型中描绘增强子等基因调控元件的编码规律，探索顺式调控突变对形态学表型的影响，开发高通量基因组编辑工具，探索“合成-演化-发育生物学（synthetic evo-devo）”这一新兴方向。
(#标注通讯作者)
1. Li XC#, Fuqua T, van Breugel ME, Crocker J#. 2023. Mutational scans reveal differential evolvability of Drosophila promoters and enhancers. Phil. Trans. R. Soc. B. 378:20220054.
2. Li XC#, Gándara L, Ekelöf M, Richter K, Alexandrov T, Crocker J#. 2022. Laboratory evolution of flies to morphogen dosage via rapid maternal changes reveals predictable outcomes. bioRxiv 2022.09.28.509860; doi: https://doi.org/10.1101/2022.09.28.509860.
3. Li XC#, Fay JC. 2019. Multiple changes underlie allelic divergence of CUP2 between Saccharomyces species. G3: Genes, Genomes, Genet. 9(11):3595–3600.
4. Li XC#, Peris D, Hittinger CT, Sia EA, Fay JC#. 2018. Mitochondria-encoded genes contribute to the evolution of heat and cold tolerance in yeast. Sci. Adv. 5(1):eaav1848.
5. Baker EP, Peris D, Moriarty RV, Li XC, Fay JC, Hittinger CT#. 2018. Mitochondrial DNA and temperature tolerance in lager yeasts. Sci. Adv. 5(1):eaav1869.
6. Li XC, Fay JC#. 2017. Cis-regulatory divergence in gene expression between two thermally divergent yeast species. Genome Biol. Evol. 9 (5):1120–1129.
