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菁英讲坛·回顾丨楚晓菁:整合多组学理解人类免疫和我的求学之路
    2025-05-12  浏览次数:

为深入学习贯彻党的二十大精神和二十届三中全会精神,进一步落实全国教育大会精神,引导广大生科学子掌握扎实本领,积极投身科技强国建设,做具有“四有”鲜明特征的一流人才,2025 年5月9日晚7点,由立身党支部、2024 级博士团支部、生命科学学院学生会举办的“博学同行”青年教师面对面暨“菁英讲坛”在生地楼生四教室举办。第三期邀请到楚晓菁老师与同学们进行经验分享交流。



楚晓菁老师结合其博士和博士后期间的研究成果,围绕“人类免疫功能和免疫相关疾病的调控”这一科学问题,与同学们展开交流。

在博士期间,老师主要关注遗传和代谢对于免疫功能的调控,通过整合基因组、代谢组以及免疫相关的数据,回答了“Are baseline metabolite levels related to immune parameters ?”和“Are there genetic regulators on metabolites?”两个主要问题。

在博士后期间,老师进行的工作主要是围绕结直肠癌肿瘤微环境,进行单细胞转录组学的大规模整合,以期通过肿瘤微环境对病人进行准确分型,更好的指导肿瘤免疫治疗。老师提到,单细胞整合的一个巨大的优势就是可以提高单细胞测序的分辨率发现稀有的细胞亚型。在常规的结直肠癌病人分型中,MSI分型的病人只有30%可以响应anti-PD-1的治疗。而楚老师团队建立的基于肿瘤微环境异质性的分型方法,可以根据不同的免疫细胞富集情况,更好的指导免疫治疗。

接下来,楚老师针对同学们提出的一些问题进行了回答。关于生物信息学,楚晓菁老师认为生物信息学是一门门槛低、先易后难的交叉学科,建议同学们可以利用掌握的生物学、医学知识,走数据分析和建模这两个方向。关于怎么找到研究兴趣,楚老师建议同学们多读文献、听报告、参与课题。除此之外,楚老师也回答了公派留学需要什么样的条件、出国读书有哪些好处、怎么学习转录组学等问题,令在座的同学收获满满。



同时,楚晓菁老师还向各位同学介绍了自己的成长经历。她提到自己本科期间一直都是比较普通的一员,之所以走到现在,是因为自己一直没有放弃。关于为什么选择生物信息学,老师讲到,是源于高中时期参加的科研社会实践项目,用生物信息学进行帕金森药物的虚拟筛选。即便在当时高考的环境下,参加科研社会实践是一件看似费时费力又没有回报的事情,但后来在本科期间,她借助该项目获得了“课外学术论文奖”时,努力第一次获得回报。同时,也因为这个奖项获得了保研加分。再后来老师的博士文章中用到的PyMol软件作图,也是源于高中时期的学习。老师说,我们做过的每一件事都会在适当的时候反馈回来,只要不放弃。

最后,老师向大家分享了张泽民主任在北京大学2024年研究生毕业典礼上的发言,她说:人的选择都是在理想和现实之间寻求交集,希望同学们不要轻易降低自己的理想,努力提高自己的现实,要相信自己的理想,这样才能不断地追寻理想,去到更远的未来。


 

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